Фамилия Семянишных — яркий представитель севернорусской ономастической традиции, а именно фамилий на -их/-ых. Такая модель указывала на принадлежность к целому роду или дому: «ты из чьих?» — «из Семянишных». В центральных и южных губерниях закрепились фамилии на -ов/-ев, а на Русском Севере (Архангельская, Вологодская, Вятская губернии) и в Сибири, куда переселенцы унесли этот обычай, прижилась форма множественного числа родительного падежа.

Основа фамилии — прозвище Семянишный (или Семянишной). Разбираем его по составу: корень семян- отсылает к слову «семя». Это могло быть прозвище земледельца, сеятеля, или же человека, занимавшегося торговлей семенами. В крестьянском быту отношение к семенам было трепетным — от них зависел урожай, а значит, и жизнь. Прозвище могло закрепиться за рачительным хозяином, который умело отбирал и хранил посевной материал.

Версия с уменьшительным суффиксом -ишн- (сравните: «Семён» — «Семянишный») маловероятна, хотя и возможна. Скорее, это притяжательное прилагательное, образованное от прозвища Семяня, Семяна, которое, в свою очередь, восходит к тому же «семени». Суффикс -ишн- здесь играет роль, аналогичную -ов- в фамилиях типа Петров, но в северном диалектном варианте.

Интересно, что фамилия не имеет отношения к имени Семён (через «ё»), хотя по звучанию это напрашивается. В основе лежит именно нарицательное существительное, что делает фамилию «говорящей» для потомков: предок был, скорее всего, крестьянином-землепашцем, для которого семя было главным богатством. Вариант написания с окончанием -ых (а не -их) — Семянишных — указывает на то, что в роду закрепилась именно эта падежная форма, а не «Семянишных» (с ударением на другой слог). Встречается фамилия редко, что типично для северных фамилий на -их, которые не получили такого массового распространения, как «овские».