Фамилия Сенюткина образована от имени Сенютка — одной из народных, обиходных форм канонического имени Семён. Само имя Семён восходит к древнееврейскому Шимон и означает «услышанный Богом в молитве». На русской почве это имя дало десятки уменьшительных и просторечных вариантов: Сема, Сеня, Сенюта, Сенютка. Именно последняя форма и легла в основу фамилии.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная. От имени Сенютка притяжательный суффикс -ин образовал фамилию, которая буквально отвечала на вопрос «чей ты?» — сын, внук или потомок Сенютки. Такой тип фамилий — на -ин — был особенно распространён в северных и центральных русских землях, тогда как на юге и западе чаще использовали суффикс -ов/-ев. Поэтому Сенюткины, скорее всего, имеют корни где-то в Поволжье, на Русском Севере или в среднерусской полосе.

Имя Сенютка звучит простонародно, даже фамильярно. В официальных документах, метриках и ревизских сказках так могли записать крестьянина, ремесленника или мещанина — человека, который в быту звался не полным именем, а домашним, сокращённым. Дворянские роды чаще фиксировали более книжные формы, поэтому основатель рода Сенюткиных, по всей вероятности, принадлежал к простому сословию. Это не делает фамилию менее интересной, а наоборот — указывает на живую, разговорную традицию именования, которая существовала в народе веками.

Интересно, что фамилия сохранила именно форму Сенюткин, а не, скажем, Сенин или Семёнов. Это говорит о том, что в роду закрепилось конкретное прозвище или обиходное имя конкретного предка — того самого Сенютки, чьи потомки и стали Сенюткиными. Со временем фамилия устоялась, перестала восприниматься как указание на отца и стала родовым именем, передающимся по наследству.