Фамилия Сепкин — одна из тех, что кажутся простыми, но при ближайшем рассмотрении ставят перед исследователем выбор между несколькими версиями. Ключ к разгадке — в основе «Сеп-» и суффиксе -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — сын Сепы, человек из семьи Сепы.

Самая прямая и правдоподобная версия ведет к разговорной форме крестильного имени. В святцах есть имя Сепфор (библейское Сепфора, жена Моисея). В народном обиходе его могли сократить до простого и удобного в быту «Сепа». Отсюда и «Сепкин» — «сын Сепы». Менее вероятно, но возможно, что основой стало имя Степан (через форму Степа → Сепа), однако такой переход для русского языка нехарактерен: обычно Степан дает фамилии Степанов, Степанкин, Степкин.

Вторая версия — прозвищная, хотя и более редкая. В некоторых западных и южных говорах «сепкой» называли занозу, колючку или, в переносном смысле, приставучего, назойливого человека. Если прозвище Сепа закрепилось за таким человеком, фамилия могла родиться и оттуда. Но этот вариант уступает первому по частоте: фамилии от мирских прозвищ с корнем «сеп-» встречаются реже, чем от календарных имен.

Интересна и география. Фамилия Сепкин не относится к числу широко распространенных по всей России. Её очаги тяготеют к регионам бывшей Пензенской губернии и прилегающим территориям. Там же, в мордовской и татарской среде, встречается фамилия Сепкин, образованная от тюркского имени Сеп (от «сеп» — «украшение, наряд»). В русском контексте эта версия выглядит заимствованной, но для носителей из Поволжья она может быть основной.

Что касается социального происхождения, то -ин — типичный суффикс для фамилий крестьян и мещан центральной России. Сепкины, скорее всего, были не дворянами, а людьми из податных сословий: крестьянами, ремесленниками, однодворцами. Точных сведений о древности рода нет, но по модели образования фамилия сложилась не позднее XVII–XVIII веков, когда процесс массового закрепления фамилий у простого населения шел полным ходом.