Фамилия Сепкина — женская форма, а мужская — Сепкин. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать основу, а она неочевидна. На первый взгляд, фамилия похожа на отчества от канонических имён вроде Степан или Семён, но это не так: в них суффикс -ин присоединялся к основе, оканчивающейся на -а или -я (Степа — Степин, Сёма — Сёмин). В Сепкине корень «Сепк-», а не «Сеп-», поэтому модель другая.

Скорее всего, в основе лежит прозвище или нецерковное имя Сепка. Оно могло быть образовано от глагола «сепать» — в некоторых русских говорах это означало «бить, хлестать» или «отделять, разнимать». Человека с таким прозвищем могли назвать за резкий характер или за работу, связанную с разделением чего-то (например, в лесном деле — сепать кору). Есть и другая версия: Сепка — это краткая форма от имени Сепан, диалектного варианта имени Степан (от греческого Стефанос — «венок»). В этом случае фамилия — просто патроним, но с необычной огласовкой, характерной для северных и сибирских говоров, где «Степан» могли произносить как «Сепан».

Географически фамилия Сепкины встречается нечасто, но имеет очаги в Вятской губернии и в некоторых районах Сибири, куда переселялись вятские крестьяне. Это указывает на возможное происхождение из северорусской или вятской диалектной среды. Суффикс -ин типичен для русских фамилий, образованных от слов или имён на -а, -я, так что Сепкин — типичная по форме, но редкая по корню фамилия.

Если говорить о социальном контексте, то в документах XVIII–XIX веков Сепкины встречаются среди государственных крестьян и мещан — никакого дворянства или известных исторических лиц с этой фамилией не зафиксировано. Это фамилия простого человека, чьё прозвище или имя закрепилось в официальных бумагах и дошло до нас.