Фамилия Сейпианова — редкая, спорадическая, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от тысяч фамилий на -ов, образованных от крестильных имён или названий профессий, эта явно не входит в основной массив русского ономастикона. Первое, что бросается в глаза, — нехарактерный для славянских языков корень «Сейпиан-» и суффикс -ов. Фамилия явно несёт следы иноязычного влияния, скорее всего, тюркского или кавказского.

Словообразовательная модель здесь проста: основа «Сейпиан» + суффикс -ов (в женском роде -ова). Суффикс указывает на принадлежность: «чей?» — Сейпианов, то есть потомок или человек из рода Сейпиана. Сама основа «Сейпиан» — это, вероятно, личное имя или прозвище. В тюркских языках (например, в кумыкском, ногайском, карачаево-балкарском) распространены имена с элементом «Сейп-» или «Сейип», восходящим к арабскому «сахиб» — «господин, владелец, хозяин». «Сейпиан» может быть формой с притяжательным аффиксом -ан, что даёт значение «принадлежащий Сейипу» или «Сейипов сын». Таким образом, исходное имя Сейип (или Сейпи) могло означать «господин» или «владелец», а фамилия по отцу закрепилась как Сейпианов.

Есть и вторая, менее вероятная, версия, связывающая фамилию с иранскими или армянскими корнями. В армянском языке существует фамилия Сейпян (от «сейп» — «владелец»). Русский суффикс -ов мог добавиться к ней в процессе русификации, превратив Сейпян в Сейпианов. Однако форма «Сейпианова» с ударением на второй слог (Сейпи́анова) чаще встречается именно в тюркоязычной среде Северного Кавказа, Дагестана или Поволжья, где такие фамилии фиксировались при переписях.

Географически фамилия Сейпианова сегодня встречается в рассеянном виде, но с заметным тяготением к югу России: Ставропольский край, Карачаево-Черкесия, Чечня, а также в среде татар. Это подтверждает версию о тюркском происхождении. Носители фамилии могли быть потомками узденей (свободных крестьян) или купцов, чьё имя или прозвище указывало на статус «хозяина», «владельца» (скота, земли). В дореволюционных метрических книгах фамилия почти не встречается, что говорит о её позднем закреплении — скорее всего, в конце XIX — начале XX века, когда крестьянам массово присваивали фамилии по имени отца. Так что предки носительницы фамилии Сейпианова, скорее всего, были людьми свободными, но не знатными, и их родовое имя — это просто память о родоначальнике по имени Сейип.