Фамилия Сейсепова — редкий случай в русском ономастиконе. Её основа и словообразовательная модель указывают на тюркское происхождение, скорее всего, казахское или ногайское. Разберём состав: корень «Сейсеп» и русский патронимический суффикс «-ов», адаптированный к женскому роду как «-ова». Мужской вариант — Сейсепов. Суффикс «-ов» в тюркских фамилиях — стандартный способ русификации: его добавляли при переписях и оформлении документов в XIX–XX веках, чтобы вписать фамилию в русскую грамматику.

Корень «Сейсеп» восходит к личному имени Сейсеп (варианты: Сейсепбай, Сейсепқұл). В тюркских языках это имя сложное: первая часть «сей» (сейіс) может означать «уважаемый», «почтенный» или быть вариантом арабского «сайид» (господин, потомок пророка). Вторая часть «сеп» переводится как «украшение», «снаряжение» или «приданое». Таким образом, имя Сейсеп могло значить «почтенное украшение» или «уважаемое достояние». Встречается также версия, что «сеп» — это усечённая форма от «сепкен» (тот, кто дал), но это менее вероятно.

Географически фамилия Сейсепова привязана к Западному Казахстану и прилегающим областям России (Астраханская, Оренбургская, Волгоградская). Носители — потомки казахов Младшего жуза или ногайцев, которые после присоединения региона к Российской империи получили фамилию по имени предка. В метрических книгах и ревизских сказках XIX века фамилия почти не встречается — это говорит о её позднем закреплении, возможно, уже в советское время при паспортизации.

Отличительная черта фамилии — отсутствие однозначного толкования в славянской среде. Если бы она была русской, её можно было бы спутать с диалектным словом «сейсеп» (нечто вроде «сей» + «сепь»), но таких лексем в русских говорах нет. Поэтому все версии упираются в тюркскую антропонимику. Сравните с фамилиями Сейсенов, Сейсекеев — они из того же гнезда, с тем же корнем «сей» и разными вторыми компонентами.

Социальный контекст: предки Сейсеповых, скорее всего, не принадлежали к знати или духовенству. Имя Сейсеп — личное, а не родовое, и фамилия от него образована по самой простой модели (имя + -ов). Это указывает на крестьянское или скотоводческое происхождение: при наделении фамилиями брали имя отца или деда, без привязки к титулу или должности.