Фамилия Шаборшина — женская форма фамилии Шаборшин, и её происхождение неочевидно с первого взгляда. В ней нет типичного суффикса -ов/-ев, который указывал бы на прямое отчество от крестильного имени. Вместо этого основа «Шаборш-» заканчивается на шипящий, что наводит на мысль о прозвищном происхождении или о редкой словообразовательной модели.

Скорее всего, в основе лежит прозвище Шаборша. Его можно связать с диалектным словом «шабор» или «шабура». В русских говорах «шабурой» называли плохую, старую одежду, лохмотья, а также нерадивого, неряшливого человека. В этом случае Шаборшей могли прозвать человека, который ходил в рваной одежде или был неопрятен. Есть и другая версия: в некоторых регионах «шабор» означало «сосед», «шабер» — товарищ. Тогда прозвище могло относиться к пришлому человеку или, наоборот, к постоянному соседу.

Суффикс -ш- в основе — редкий. Фамилии типа Шаборшин, Шавырин, Шабуров обычно строятся от прозвищ, оканчивающихся на -ша, -шура. Такие прозвища часто носили снисходительно-ироничный оттенок. Фамилия Шаборшина, таким образом, — это «дочь (или жена) Шаборши». Географически фамилия встречается спорадически, без явной привязки к одному региону, что типично для прозвищных фамилий, возникших в разных говорах независимо.

Версия о происхождении от крестильного имени (например, от редкого имени Севастиан через народную форму «Шабаш») маловероятна — для этого не хватает фонетических переходов. Более правдоподобно, что предок носителя фамилии получил уличное прозвище по особенности внешности или поведения, и оно закрепилось за родом.