Фамилия Шаехов — один из редких примеров, где исходное слово не сразу бросается в глаза. Она образована от имени или прозвища Шаех. В основе, скорее всего, лежит арабское имя Шаих (Шаех) — вариант имени Шейх, что значит «старейшина», «вождь», «уважаемый человек». В тюркской среде, особенно у татар и башкир, это слово приобрело дополнительный оттенок: так могли называть не только духовного наставника, но и просто уважаемого старца или основателя рода.

Суффикс -ов указывает на русскую модель фамилии, которая закрепилась за носителями при переходе на русское делопроизводство. Если бы фамилия осталась в чисто тюркской форме, она звучала бы как Шаех улу или Шаехов — с другим патронимическим показателем. Фактически Шаехов — это русифицированная версия, где к основе добавили стандартное русское окончание принадлежности: «чей? — Шаехов», то есть «сын Шаеха».

Географически фамилия встречается в Татарстане, Башкортостане и среди казанских татар, рассеянных по регионам Поволжья. Встречаются варианты написания через «и» — Шаихов, но форма с «е» более архаичная, она могла закрепиться в документах XIX века, когда писцы записывали имя на слух, не унифицируя гласные.

Версия о происхождении от профессионального прозвища «шаех» (мастер по изготовлению шаек — мелких гвоздей) маловероятна. Слово «шайка» в значении «гвоздь» — узкотерриториальное и бытовало в основном в северных говорах, где фамилия Шаехов почти не встречается. Поэтому арабско-тюркский корень остается основным.

Сословно фамилия не привязана к дворянству или духовенству: Шаеховы могли быть и крестьянами, и купцами, и муллами. Значение фамилии — «потомок уважаемого человека» — сохраняет память о предке, которого в своей среде называли Шаехом, то есть старшиной или наставником.