Фамилия Шафикина — женская форма от Шафикин, и её происхождение напрямую связано с именем или прозвищем предка-мужчины. Основа здесь — «Шафик» (или «Шафики»), что в переводе с арабского означает «сострадательный», «милосердный», «жалеющий». Это одно из имён-эпитетов, распространённых в мусульманской культуре, особенно у татар, башкир и народов Кавказа. Суффикс «-ин» в русской модели образования фамилий указывает на принадлежность: «чей?» — «сын (или потомок) Шафика». То есть Шафикины — это буквально «люди из рода Шафика».

В отличие от фамилий на «-ов» (которые чаще встречаются у русских), фамилии на «-ин» в среде татар и башкир тоже весьма типичны, но здесь есть важная деталь: форма «Шафикина» могла закрепиться не только по отцу, но и по матери. Если главу семьи звали Шафик, его детей записывали Шафикиными, но в случае, когда фамилия передавалась от матери-вдовы или от бабушки, суффикс «-ин» мог указывать на женскую линию. Однако для XIX века, когда фамилии массово фиксировались, это скорее исключение.

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и Предуралью — к регионам, где исламские имена органично вписались в русскую паспортную систему после крещения или, чаще, при записи в метрические книги мечетей. Встречается она и у крымских татар, но там более характерна форма Шафиков. В написании «Шафикина» могла отразиться диалектная особенность: в некоторых тюркских говорах имя произносили с мягким «к» на конце, что и дало суффикс «-ин», а не «-ов».

Спорных версий здесь немного. Иногда ошибочно связывают с арабским «шафи» (исцелитель), но это другое слово. Более правдоподобно, что в основе лежит не просто имя, а прозвище Шафика — так могли назвать человека с мягким, жалостливым характером. В любом случае, носительница фамилии Шафикина может быть уверена: её предок был человеком, которого окружающие ценили за доброту, или же носил почётное мусульманское имя, подчёркивающее эту черту.