Фамилия Шагаланов в своей основе имеет тюркское прозвище, что для южнорусских, уральских и сибирских фамилий — обычное дело. Разбираем её по составу: корень «шагала» и два суффикса — сначала тюркский «-ан», затем русский патронимический «-ов». Такая двойная «русификация» говорит о том, что фамилия сложилась не в центральной России, а на окраинах, где русские встречались с тюркскими народами.

Самая вероятная версия происхождения — от тюркского слова «шагал» или «шакал». В тюркских языках (казахском, татарском, башкирском) «шагал» — это и есть шакал, животное, известное своей хитростью, наглостью и способностью выживать в любых условиях. Прозвище Шагал могли дать человеку либо с соответствующим характером (изворотливый, пронырливый, ловкий), либо за внешнее сходство — худоба, острота черт. Суффикс «-ан» в тюркских именах часто усиливает значение или указывает на принадлежность: Шакалан — «тот, кто связан с шакалом», «шакалистый». Затем к этой основе русские приписали «-ов», чтобы получить фамилию по отцу: сын Шагалана — Шагаланов.

Есть и другая, менее распространённая гипотеза: от тюркского имени Шаги (Шах-Гирей, Шах-Али) с добавлением «-ан». Но в этом случае форма была бы скорее Шагианов или Шаханов. Вариант с «шакалом» фонетически и логически убедительнее — он объясняет и редкий суффикс, и само звучание.

Географически фамилия Шагаланов встречается в основном на Южном Урале (Оренбургская, Челябинская области) и в Западной Сибири — как раз в зоне контакта русских с казахами и башкирами. Предки носителей этой фамилии, скорее всего, были либо казаками, либо крестьянами, которые переняли тюркское прозвище от соседей или от одного из предков-тюрков. В дворянских родословных книгах фамилия не зафиксирована — она однозначно крестьянская или казачья.