Фамилия Шаховенко — характерный пример восточнославянской фамилии, образованной по продуктивной модели с суффиксом -енко. Этот суффикс, типичный для украинской ономастики, означает «маленький», «сын» или «потомок». Таким образом, Шаховенко буквально — «сын Шахова» или «потомок Шахова». В основе лежит прозвище или имя Шах, которое могло иметь разные корни.

Самая вероятная версия связывает основу с тюркским словом «шах» — «царь», «властитель», «господин». В южнорусских и украинских степях это слово могло попасть в прозвище через контакты с татарами или турками. Шахом могли называть человека властного, богатого, гордого или того, кто носил соответствующую одежду. Менее распространённая, но возможная версия — от церковного имени Шах (редкая форма от Исаакий или Исайя), однако для украинской среды это нетипично.

Географически фамилия Шаховенко тяготеет к центральным и восточным областям Украины, особенно к Полтавщине и Черкасщине. В России она встречается реже, обычно в приграничных с Украиной регионах. Интересно, что есть и фамилия Шахов, от которой Шаховенко является прямым «патронимическим» производным. Сравнение показывает, что Шахов — более старая форма, а Шаховенко возникла позже, когда суффикс -енко стал массово вытеснять -ов/-ев в украинской среде.

Сословная принадлежность первых носителей, скорее всего, была казацкой или крестьянской. Фамилии на -енко в XVII–XVIII веках активно формировались среди запорожских казаков и реестрового казачества, а затем закрепились у сельского населения. Дворянских родов с такой фамилией в официальных родословных книгах Российской империи не зафиксировано, что подтверждает её народное происхождение.

Если говорить о письменной истории, то в ревизских сказках и исповедных ведомостях XIX века Шаховенко встречаются как крестьяне и мещане. Фамилия не получила широкой известности в среде знаменитостей, что делает её типичной для своей среды — фамилией простого человека, чьи предки жили на юге Руси и носили прозвище, связанное с восточным титулом.