Фамилия Шакирдзянов — тюркская по происхождению, а точнее, татаро-башкирская. Её основа — арабское имя Шакирдзя́н, которое состоит из двух частей. Первая, «Шакир» (от арабского «шакир» — «благодарный»), — распространённый компонент мусульманских имён. Вторая, «дзя́н» (или «джан»), — персидское слово, означающее «душа», «жизнь». Вместе имя Шакирдзя́н можно перевести как «благодарная душа» или «живущий с благодарностью».

Русский суффикс -ов добавили к этой основе по стандартной модели для фамилий, указывающих на принадлежность: «чей?» — «Шакирдзянов», то есть «сын Шакирдзяна». Поэтому фамилия прямо говорит о том, что предок носителя носил это составное имя.

В отличие от многих фамилий на -ов, которые закрепились в русской среде, Шакирдзянов — яркий пример того, как тюркские народы, приняв ислам (а с ним и арабскую письменность), адаптировали арабские и персидские имена, а затем, войдя в состав Российской империи, оформили их по русской грамматике. Это делает фамилию не просто родовым прозвищем, а маркером культурного синтеза: арабская религиозная традиция, персидская поэтичность и русский административный учёт.

Географически фамилия чаще всего встречается в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях — регионах традиционного проживания татар и башкир. Вариант с окончанием -ов (а не -ин) указывает на то, что фамилия формировалась в среде, где преобладала модель на -ов, а не, скажем, на -ин, типичная для некоторых тюркских фамилий, образованных от имён на -а/-я.

Сословная принадлежность предков Шакирдзяновых могла быть разной. В среде татарского купечества и духовенства такие имена были часты, но и крестьяне, получив фамилию при переписи, могли носить её. Никакой узкой профессиональной привязки у неё нет — только личное имя родоначальника.