Фамилия Шаколин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её первая мысль, которая приходит на ум: связь с шакалом. Но это ложный след. Слово «шакал» пришло в русский язык из тюркских или персидских языков, а суффикс -ин в русских фамилиях чаще всего указывает на принадлежность к человеку: «чей?» — «Шаколин». Если бы фамилия была образована от животного, она звучала бы как Шакалов, а не Шаколин.

Ключ к разгадке — основа «Шакол-». Скорее всего, это вариант личного имени или прозвища Шакол. В русских говорах и соседних языках встречаются созвучные корни. Например, в диалектах «шакать» означало «шататься, бродить без дела», а «шакол» могли назвать непоседливого человека или бродягу. В ономастике известны фамилии Шаков, Шакин, Шаколин — они восходят к имени Шак, которое могло быть сокращением от крестильного имени Исаак (в народной форме Исак, Сак). Шаколин — это «сын Шакола», где Шакол — уменьшительно-ласкательная или прозвищная форма от Шак.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с тюркским словом «шак» (шах, царь) или «шакыр» (благодарный). В таком случае Шаколин — русифицированная форма фамилии, принесённая татарскими или башкирскими родами, которые переходили на русскую службу и получали крестильные имена, но сохраняли прозвищную основу.

Географически фамилия Шаколин встречается в центральных областях России — в Поволжье, Нижегородской области, а также в Удмуртии. Это указывает на возможное смешение русских и финно-угорских или тюркских корней. В дореволюционных переписях Шаколины чаще всего числились государственными крестьянами — не дворяне, не купцы, а люди, жившие общинным укладом.

Суффикс -ин, а не -ов, говорит о том, что основа оканчивалась на согласный: Шакол. Такая модель типична для прозвищ и имён, а не для названий профессий. Поэтому предки Шаколиных — не ремесленники и не служилые люди, а скорее крестьяне, получившие фамилию по личному имени или характерной черте своего родоначальника.