Фамилия Шалджиян — редкий пример фамилии, в которой славянская по происхождению основа соединилась с армянским патронимическим суффиксом. Носитель такой фамилии, скорее всего, потомок армян, живших на юге России или в Крыму, где русская культура влияла на быт и язык.

Ключ к пониманию — основа «Шалдж». Она восходит к русскому прозвищу или профессии «шалджия». В южнорусских и украинских говорах «шалджия» — это человек, который шалит, проказничает, баламут. Слово образовано от глагола «шалить» с характерным тюркским суффиксом «-джи» (обозначающим деятеля, как в «кофеджия» — любитель кофе). Такое прозвище мог получить озорной, непоседливый человек или, реже, скоморох.

Армянский суффикс «-ян» (и его вариант «-иян») означает принадлежность к роду, потомка. Таким образом, Шалджиян буквально — «потомок Шалджии», то есть внук или сын того самого озорника. Фамилия сложилась в среде, где армяне уже говорили по-русски, но сохраняли свою модель образования фамилий.

Географически фамилия тяготеет к Краснодарскому краю, Ростовской области и Ставрополью — регионам, где исторически существовали крупные армянские общины (черкесогаи, крымские армяне). Встречается она и в Армении, но реже: там для армянского уха основа звучит как явное заимствование.

Других версий происхождения, например от тюркского корня, нет: слово «шалджи» в тюркских языках не зафиксировано в значении, подходящем для прозвища. Вероятнее всего, перед нами гибридная форма, возникшая на стыке культур в XIX веке.