Фамилия Шаликаров звучит непривычно для центральной России, и это не случайность. Её основа восходит к тюркским языкам — скорее всего, к казахскому или башкирскому. Корень «шали» или «шала» в ряде тюркских наречий означает «полу», «недостаточный» или «неполноценный», а в переносном смысле могло относиться к человеку с физическим изъяном или к тому, кто родился недоношенным. Однако есть и другая версия: в некоторых диалектах «шала» — это прозвище для бойкого, суетливого человека, того, кто «мечется» (от глагола «шалу» — «суетиться»).

Суффикс -ов указывает на русскую адаптацию фамилии, которая произошла в XIX–XX веках. Изначально тюркские фамилии часто оформлялись окончанием -ов/-ев при записи в метрические книги или паспорта, особенно если носители жили в смешанных регионах — например, в Оренбургской, Астраханской губерниях или в Казахстане. Таким образом, Шаликаров — это русифицированная форма тюркского прозвища Шаликар (или Шалакар), где компонент «кар» может означать «снег» (в некоторых тюркских языках) или быть усилительной частицей. Получается «снежный, белый» — но это менее вероятно, так как смысл «полуснег» нелогичен.

Наиболее правдоподобная версия: предок носителя фамилии получил прозвище Шали (или Шала) за особенности внешности или поведения, а суффикс -кар (от персидского «кар» — «делающий, работник») добавил значение «тот, кто делает что-то с изъяном» или «человек, похожий на Шалу». В русской канцелярской практике это прозвище записали как Шаликар, а затем добавили фамильный суффикс -ов. Фамилия редкая, её носители сосредоточены в основном в Западном Казахстане, Башкортостане и среди татар. Встречаются также варианты Шаликаров и Шаликаров — с ударением на второй или третий слог, что зависит от местного произношения.