Фамилия Шалкарбекова — женская форма мужской фамилии Шалкарбеков, имеющая очевидное тюркское происхождение. Она образована по распространённой в казахской и других тюркских ономастиках модели: личное имя + титул «бек» (господин, князь, правитель) + русский патронимический суффикс -ов/-ев, который в XIX–XX веках добавляли при русификации фамилий в Российской империи. Таким образом, Шалкарбеков буквально означает «потомок Шалкарбека», где Шалкарбек — составное мужское имя.

Разберём имя-основу. Первая часть — «Шалкар» — восходит к казахскому слову «шалқар» (широкий, просторный, величественный; также — разлившееся озеро). В переносном смысле имя могло означать «щедрый», «обильный», «великодушный». В казахской антропонимике Шалкар — редкое, но известное имя, которое давали с пожеланием ребёнку широкой души и благополучной жизни. Вторая часть — «бек» — указывает на знатное происхождение или уважаемое положение: беками называли военачальников, старейшин, землевладельцев. Однако в составе личного имени «бек» мог быть и просто пожелательным компонентом, не обязательно свидетельствующим о реальном титуле предка.

Вероятнее всего, фамилия Шалкарбекова сформировалась в среде казахского населения, которое после вхождения в состав Российской империи начало фиксировать фамилии по русскому образцу. Географически фамилия встречается прежде всего в Казахстане, а также среди казахов, живущих в сопредельных регионах России (Оренбургская, Астраханская области, Алтай). В отличие от многих фамилий на -ов, корень «Шалкар» остаётся прозрачным для носителей казахского языка, что делает фамилию «говорящей»: она сразу указывает на этническую принадлежность и на значение имени предка. Интересно, что в русском языке фамилия сохраняет ударение на последнем слоге основы — Шалкарбе́кова, что типично для заимствованных тюркских имён с компонентом «бек».