Фамилия Шакарбекова — женская форма мужской фамилии Шакарбеков, и её происхождение напрямую связано с мусульманским миром Центральной Азии. В основе лежит сложное имя Шакарбек, где первая часть «Шакар» восходит к персидскому «шаккар» — сахар, сладость. В переносном смысле это означало «сладкий», «приятный», «любимый». Вторая часть — тюркский титул «бек» (господин, князь, правитель). Таким образом, имя Шакарбек можно перевести как «сладкий господин» или «любимый правитель» — типичное для тюрко-персидской ономастики сложение, где эпитет усиливает социальный статус.

Словообразовательная модель здесь проста и прозрачна: к мужскому имени Шакарбек добавили русский суффикс -ов, а затем окончание -а, указывающее на женский род. Такая модель была стандартной для русификации фамилий народов Средней Азии и Кавказа в XIX–XX веках, когда при документальном оформлении к местным именам и прозвищам приписывали русские патронимические суффиксы. Фамилия Шакарбекова — не автохтонная русская, а «вторичная», возникшая в результате межкультурного контакта.

Географически фамилия Шакарбекова наиболее распространена среди народов, говорящих на тюркских и иранских языках: в первую очередь у казахов, киргизов, узбеков, а также у таджиков. Встречается она и у ногайцев, и у некоторых групп татар. В России её носительниц можно встретить преимущественно в регионах с компактным проживанием этих народов — в Оренбургской, Астраханской областях, в Татарстане, а также в крупных городах, куда мигрировали жители Средней Азии.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Шакарбекова стоит в одном ряду с Шакаровыми (где основа — просто «Шакар», без титула) и Бековыми (где основа — только «бек»). Интересно, что в некоторых тюркских языках слово «шакар» могло также означать «шакал» (как заимствование из санскрита), но для фамилии Шакарбекова эта версия маловероятна: имя с таким значением вряд ли соединили бы с титулом «бек» — социальная логика говорит в пользу «сладкого» значения.

Социальный статус предков-носителей мужского имени Шакарбек, скорее всего, был выше среднего: имя с компонентом «бек» давали в семьях, имевших отношение к местной знати, военной верхушке или зажиточному сословию. Однако со временем фамилия стала массовой и утратила сословную привязку — сегодня её носит множество людей самого разного происхождения.