Фамилия Шалушкина — женская форма фамилии Шалушкин, и её происхождение стоит искать в прозвище или мирском имени дальнего предка. В основе лежит слово «шалушка» — в русских говорах так называли не только озорного ребёнка, но и человека, склонного к шалостям, проказам, непоседливого. В словаре Владимира Даля «шалушка» — это прямо «проказница, резвушка», что указывает на прозвище, данное за живой, бойкий нрав.

Словообразовательная модель здесь прозрачная: суффикс -ин- (в женском роде -ина) указывает на принадлежность. Шалушкин — буквально «сын Шалушки», то есть потомок человека по прозвищу Шалушка. Такие фамилии на -ин типичны для северных и центральных областей России, где активно использовались прозвищные формы с уменьшительными суффиксами. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще образовывались от полных форм имён, -ин закреплялся за основами на -а/-я.

Интересно, что фамилия Шалушкин не так распространена, как её однокоренные «собратья» — Шалунов или Шалимов. Это говорит о том, что прозвище Шалушка было скорее местным, диалектным, а не общерусским. Встречается она преимущественно в Поволжье и на Урале, где сохранились архаичные говоры. В документах XVII–XVIII веков можно найти крестьян и посадских людей с таким прозвищем, но массовой дворянской фамилией она не стала — скорее всего, предки Шалушкиных были из крестьян или мещан.

Есть и другая, менее вероятная версия: от слова «шалушка» в значении «небольшая шаль, платок» (диалектное). Но в этом случае прозвище мог получить торговец или мастер, шивший такие платки. Однако ономасты склоняются к первой версии — прозвище по характеру, поскольку большинство русских фамилий на -ин образовано именно от личных прозвищ, а не от названий предметов. Так что, скорее всего, первый Шалушка был человеком живым и озорным, и память об этом осталась в фамилии.