Фамилия Шаманькова звучит редко и цепляет слух неожиданным корнем. В отличие от множества фамилий на -ов/-ев, образованных от крестильных имён (Иванов, Петров), эта явно происходит от прозвища или мирского имени. Основа здесь — «шаман», и это сразу задаёт главную версию происхождения.

Слово «шаман» в русский язык пришло из тунгусских языков, но закрепилось в общем значении «колдун, знахарь, языческий жрец». В северных и сибирских говорах шаманом могли назвать не только настоящего служителя культа, но и любого человека, который знался с «нечистой силой», заговаривал болезни или ворожил. Однако не стоит думать, что предок носительницы фамилии был непременно сибирским камлателем. В центральной России прозвище Шаман давали либо знахарю-травнику, либо человеку с необычным, странным поведением — «чудит, как шаман». В. И. Даль в своём словаре фиксирует слово «шаманить» в значении «колдовать, ворожить, знахарить», а также «шаман» — «колдун, волшебник». Таким образом, прозвище могло относиться к реальному ремеслу или к внешней характеристике.

Фамилия образована по русской модели с суффиксом принадлежности -ов-: Шаманьков — сын Шаманька. Форма «Шаманько» — это украинская или южнорусская уменьшительная форма прозвища (с суффиксом -к-о, характерным для западнорусских земель). Со временем, при адаптации к великорусской норме, фамилия получила окончание -а, став Шаманькова (женская форма). Такое чередование (Шаманько → Шаманьков) встречается нечасто и выдаёт в фамилии «переселенческий» след: предки могли прийти на север или в центр России из чернозёмных областей или с Украины.

Важная деталь: в говорах слово «шаман» могло звучать иначе — «шамань» с мягким знаком на конце. Отсюда и мягкий согласный в основе. В отличие от фамилии Шаманов (прямая, без уменьшительного суффикса), Шаманькова несёт в себе оттенок ласкательности или иронии: называли не просто Шаман, а Шаманька — возможно, молодого парня, который только начинал «шаманить», или человека, которого в шутку величали колдуном.

Географически фамилия встречается крайне редко, что подтверждает её локальное происхождение. Чаще всего такие фамилии фиксируются в Вологодской, Архангельской областях и на Урале — в зонах, где сохранялись старые промыслы и вера в знахарей, либо где оседали переселенцы с юга. Точных данных о дворянском происхождении нет: скорее всего, это крестьянская или мещанская фамилия. Сословная принадлежность предков — свободные землепашцы или ремесленники, получившие прозвище за своё занятие или характер.