Фамилия Шаманников — одна из тех, где значение лежит на поверхности, но это не избавляет от неожиданных поворотов. Вопреки первому впечатлению, её основа не обязательно связана с шаманами и бубнами. Дело в том, что слово «шаман» в русских говорах имело и другое, более прозаическое значение — так в некоторых регионах называли знахаря, колдуна или просто ворожея, который лечил заговорами и травами. Для крестьянского быта это был не экзотический персонаж из Сибири, а свой, деревенский «специалист», к которому ходили за помощью. Фамилию могли дать потомкам такого человека, закрепив за ними прозвище по роду занятий предка.

Однако есть и вторая, менее очевидная версия. В русских диалектах (особенно на севере и Урале) слово «шаман» иногда использовали как бранное или ироничное прозвище для человека суетливого, непоседливого или того, кто «шаманит» — суетится, делает что-то быстро и хаотично. В этом случае Шаманников — не профессиональное имя, а характеристика поведения: «суетливый, как шаман». Различить эти две версии без точного знания истории конкретной семьи невозможно, но вторая гипотеза встречается реже и потому интереснее.

Словообразовательная модель фамилии — суффикс -ник-, который в русских фамилиях часто указывал на принадлежность к профессии или характерному занятию (сравните: Мельников, Плотников, Охотников). Двойной суффикс -ник-ов — классический патронимический формант, означающий «сын Шаманника» или «из семьи Шаманниковых». То есть сначала было прозвище Шаманник, а уже от него пошла фамилия.

Географически фамилия редкая, её корни, скорее всего, уходят в северные или уральские губернии, где диалектное слово «шаман» было в ходу. В центральных и южных областях России такое прозвище почти не встречалось. Среди однокоренных фамилий — Шаманов, Шаманский, Шаманин, но Шаманников стоит особняком из-за редкого суффикса -ник, который делает её более «ремесленной» по звучанию. Если предок был не шаманом в мистическом смысле, а просто знахарем-травником, то эта фамилия — прямое указание на его место в деревенской иерархии.