Фамилия Шамбеева — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В основе, скорее всего, лежит прозвище или имя, образованное от тюркского корня. Самый вероятный вариант — от слова «шамба» (или «шамбе»), которое в ряде тюркских языков означает «суббота». В доисламские времена у некоторых народов суббота считалась праздничным или особым днём, поэтому человека, родившегося в этот день, могли прозвать Шамба. Суффикс -ев указывает на русскую модель образования фамилии от тюркской основы: Шамбай → Шамбеев (с переходом «а» в «е» в безударном положении). Женская форма Шамбеева — это вариант по мужу или отцу.

Вторая версия, менее распространённая, связывает фамилию с персидским словом «шам» — «свеча», «огонь». В этом случае прозвище Шамба мог получить свечник, изготовитель свечей или человек со светлыми, «горящими» волосами. Однако эта гипотеза слабее: для тюркского ареала, откуда фамилия скорее всего происходит, семантика «субботы» встречается чаще.

Географически фамилия Шамбеева тяготеет к регионам с сильным татарским и башкирским влиянием — Поволжье, Урал. Встречается она и у кавказских народов, но там скорее как вариант от арабского имени Шамби (светоч). В любом случае, носительница фамилии может с высокой вероятностью предположить, что её предки жили в среде тюркских народов и получили фамилию по личному прозвищу, которое закрепилось в русской документации.

С точки зрения словообразования, фамилия стоит в ряду таких же моделей, как Сафаров, Набиев, Алиев — тюркская основа плюс русский патронимический суффикс. Ударение в русском произношении обычно падает на второй слог: Шамбе́ева.