Фамилия Шамерина — женская форма от Шамерин, и здесь интересен не столько корень, сколько сам суффикс. В русских фамилиях -ин стандартно указывает на принадлежность: «чей?» — «сын Шамеры». Но в отличие от массовых Иванов или Кузнецов, основа Шамер- встречается редко и заставляет задуматься о её происхождении.

Самая вероятная версия — прозвище Шамера из диалектного глагола «шамерить». В южнорусских и украинских говорах это слово означало «шарить, рыться, искать ощупью» или, в переносном смысле, «делать что-то небрежно, наспех». Человек, получивший такое прозвище, мог быть суетливым, неаккуратным в работе или, наоборот, любителем всё везде искать. В некоторых регионах «шамера» — это ещё и название мелкого воришки или попрошайки, того, кто «шарит по углам». Таким образом, фамилия Шамерин могла закрепиться за предком с заметной бытовой чертой.

Менее распространённая, но возможная версия — связь с тюркскими языками. В татарском «шәм» (шям) — свеча, а «шәмәре» (шамэре) — множественное или притяжательная форма. Если фамилия возникла в зоне контакта с тюркским населением (Поволжье, Урал), то Шамера могло быть прозвищем человека, связанного с изготовлением или продажей свечей, либо просто заимствованным именованием. Однако эта гипотеза слабее, так как для тюркских основ в русских фамилиях чаще характерен суффикс -ов, а не -ин.

Географически фамилия Шамерин — редкая. Её следы встречаются в центральных областях России, а также в бывших южнорусских губерниях (Курская, Воронежская), что хорошо совпадает с ареалом диалектного глагола «шамерить». Сословного барьера у фамилии не было: её мог носить и крестьянин, и мещанин, и отставной солдат — прозвище цепкое, не требующее знатного происхождения.

В написании стоит обратить внимание на безударную гласную в первом слоге: Шамерина пишется через «а», хотя в разговорной речи часто произносят «Шомерина». Ошибка в документах встречается, но этимологически верный вариант — с «а» от исходного глагола.