Фамилия Шамунова — женская форма фамилии Шамунов. Чтобы понять её происхождение, нужно разобраться с мужским вариантом. Основа фамилии — прозвище или неканоническое имя Шамун. В русской ономастике оно имеет как минимум два объяснения.

Первая версия отсылает к тюркским языкам. Слово «шамун» могло быть вариантом имени Шамгун или Шамсун, где корень «шам» (солнце, свет) встречается во многих восточных именах (Шамиль, Шамси). В таком случае Шамун — это человек, связанный со светом, «солнечный». Вторая версия видит в основе арабское имя Шамун (библейский Симеон в исламской традиции). Это имя было распространено среди татар, башкир и других народов Поволжья, откуда оно могло перейти и к русским через смешанные браки или торговые контакты.

Модель образования проста: к основе Шамун добавили русский патронимический суффикс -ов. Так на Руси делали с любым именем или прозвищем, чтобы указать на принадлежность к роду: «чей?» — Шамунов, то есть сын или потомок Шамуна. Суффикс -ов указывает на то, что фамилия оформилась в центральных и северных регионах России, где эта модель была основной, в отличие от южных областей с суффиксом -енко.

Географически фамилия Шамунова встречается нечасто. Основные очаги — Татарстан, Башкортостан, Оренбургская и Самарская области. Это подтверждает тюркскую или мусульманскую основу. В дореволюционных переписях носители Шамуновых чаще всего записаны как государственные крестьяне или мещане, то есть люди недворянского происхождения.

Таким образом, предки современных Шамуновых с высокой вероятностью были выходцами из тюркской или татарской среды, жившими в Поволжье или на Урале. Прозвище Шамун могло достаться родоначальнику либо по имени, данному при рождении, либо за внешность или характер, которые ассоциировались со «светом».