Фамилия Шамыгин образована от прозвища Шамыга, которое, вероятно, восходит к украинскому глаголу «шамати», что означает «шелестеть». Так как в старину Шелестом называли человека с тихим голосом, говорящего почти шепотом, то соответственно, можно предположить, что прозвище Шамыга также указывало на особенности голоса предка основателя фамилии. Также возможно, что прозвище Шамыга происходит от глагола «шмыгать», то есть «тереть, шаркать». В таком случае, вполне возможно, что прозвище Шамыга указывает на особенности походки предка: он мог шаркать ногами при ходьбе. Так и прозвище Шамыга закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Шамыгин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шамыга, со временем получил фамилию Шамыгин.