Фамилия Шамыков — редкий случай, где основа, скорее всего, восходит не к русскому, а к тюркскому имени. В этом её главная особенность. Модель образования простая: тюркское личное имя Шамык плюс русский патронимический суффикс -ов, который буквально означает «сын Шамыка». Такой способ формирования фамилий у русских был основным для незнатного населения в XVI–XIX веках, но здесь он наложился на нерусскую основу, что характерно для регионов активного межэтнического контакта — Поволжья, Приуралья, Сибири.

Само имя Шамык — это, по всей вероятности, вариант тюркского имени Шамиль или Шамс, в основе которого лежит арабское слово «шамс» — солнце. В тюркских языках, особенно у татар и башкир, имя могло трансформироваться, приобретая уменьшительный или ласкательный оттенок с помощью аффикса -ык. Таким образом, Шамык — это «солнышко», «светлый», и фамилия изначально несла пожелание или характеристику: «сын светлого человека». Менее вероятна, но возможна связь с тюркским словом «шам» — свеча, что тоже даёт образ света.

Географически фамилия Шамыков почти наверняка тяготеет к татарской или башкирской среде. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках её можно встретить среди крещёных татар (кряшен) или башкир, которые в процессе христианизации получали русские фамилии по имени отца. В этом смысле Шамыков — типичная фамилия-маркер, указывающая на тюркские корни предка.

Сравнение с однокоренными фамилиями подтверждает эту версию. Шамыков, Шамышев, Шамаев — все они образованы от одного корня, но с разными суффиксами. Вариант с -ов самый распространённый, а вот Шамыков выделяется тем, что основа не обрусела до конца: в ней сохранился тюркский аффикс -ык, который нехарактерен для исконно русских имён. Поэтому носитель фамилии Шамыков может с высокой долей уверенности считать, что его предок по мужской линии носил имя Шамык и был выходцем из тюркской языковой группы, скорее всего, принявшим православие.