Фамилия Шанскии — на редкость неоднозначный случай. На первый взгляд, она выглядит как типичная фамилия с суффиксом -ск-, образованная от географического названия вроде Шанск, Шанское или Шаны. Однако проблема в том, что ни один из этих топонимов не зафиксирован в старых русских землях. Ни в перечнях сел, ни в уездных списках. Это заставляет предположить, что перед нами не исконно русская фамилия, а скорее адаптированный вариант польской или украинской фамилии Szanski. В польской ономастике фамилии на -ski встречаются массово, и основа могла восходить к названию населенного пункта Шаны (Szan) или к прозвищу от слова szan — «почтение», «уважение». Второй вариант менее вероятен, но возможен.

Еще одна версия, более редкая, связана с еврейским ашкеназским происхождением. В восточноевропейских местечках фамилии на -ский нередко давали по названию города или местечка. Например, Шанск мог быть искажением от Шавли (современный Шяуляй) или от местечка Шанцы. Однако документальных подтверждений этому нет. В любом случае, написание с двумя «и» на конце — «Шанскии» — выдает старую орфографию: до реформы 1918 года прилагательные в именительном падеже мужского рода писались через «-ый» или «-ий», но в фамилиях часто закреплялось двойное «ии». Сегодня такое написание — верный признак того, что фамилия либо прошла через дореволюционные документы, либо была сознательно сохранена в старой форме.

С точки зрения социального контекста, фамилия на -ский в Российской империи чаще всего указывала на дворянское или духовное происхождение, но для Шанскии это необязательно. Фамилия могла быть семинарской — искусственно образованной в духовных училищах по названию прихода или в честь какого-нибудь святого. Но и здесь ясности нет: святого с именем Шан или Шанский в православных святцах нет. Так что, скорее всего, корни фамилии лежат за пределами великорусских губерний — в западных или юго-западных землях, где смешивались польские, украинские и еврейские ономастические традиции.