Фамилия Шарфунов имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Шарфунов уходит в XV-XVII вв. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Шарфунов способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Маловероятно, что фамилия Шарфунов связана со словом «шарф»: оно было заимствовано из французского языка достаточно поздно. Скорее всего, в основе этой фамилии лежит одно из арабских имен: Шараф («честь, почет», «высшая степень», «благородство, знатность, аристократизм») или Шариф («»знаменитый, достойный уважения). Позднее произошло выпадение гласного. Следует отметить, что фамилия Шарфунов является отчеством второго порядка: Шарфунов – сын Шарфуна, внук Шарафа (Шарифа). Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Шарфунов являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Тем не менее, фамилия Шарфунов представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.