Фамилия Шарфун — редкая и с трудом поддающаяся однозначной расшифровке. Скорее всего, она не имеет отношения к немецкому слову «шарф» (Schal), а восходит к прозвищу или диалектному слову. Наиболее правдоподобная версия связывает её с украинским или южнорусским говором, где «шарфун» могло означать «шаркун» — человек, который шаркает ногами, ходит с шумом, или, в переносном смысле, болтун, пустомеля. В некоторых говорах «шаркать» значило также «тереть», «скрести», так что прозвище могло относиться к скрипучему голосу или неаккуратной походке.

Фамилия образована без типичного русского суффикса -ов/-ев или -ин, что указывает на её возможное польское или белорусское происхождение. В польском языке «szarfa» — это лента, шарф, но окончание -ун скорее характерно для восточнославянских прозвищ (как «веселун», «говорун»). Поэтому Шарфун могло быть прозвищем человека, носившего яркую перевязь или ленту, либо того, кто их изготавливал. Встречается также версия, что основа восходит к тюркскому «шарф» — «известный, знатный», но она менее обоснована, так как фамилия почти не фиксируется в регионах активных тюркских контактов.

Географически фамилия Шарфун встречается в основном на западе Украины (Волынь, Ровенская область) и в Беларуси, единичные случаи — в Польше. Это указывает на то, что предки носителя фамилии были, вероятно, православными или униатами из мелкой шляхты или крестьянства. Сословная принадлежность неясна: Шарфуны могли быть как ремесленниками (ткачами, портными), так и простыми землепашцами, получившими прозвище за манеру поведения.

По модели образования фамилия Шарфун — это застывшая форма прозвища в именительном падеже, без дополнительных суффиксов, что типично для украинских и белорусских фамилий XVII–XVIII веков. В отличие от русских фамилий на -ов, она не указывает на принадлежность отцу (чей?), а прямо называет самого человека по его характерной черте. Если искать аналоги, то это фамилии вроде Шаркун, Шаргун — с тем же корнем и значением.