Фамилия Шаршун образована от аналогичного прозвища, которое восходит к слову «шарш». Даля это слово трактуется как «шерох». Вполне вероятно, что прозвище Шаршун получил тихий, осторожный человек. По другой версии, прозвище Шаршун этимологически связано со словом «шарш», которое в волжских говорах означает «сало по реке, передовой, осенний мелкий лед». Возможно, что Шаршуном называли ребенка, родившегося в конце осени. Согласно еще одной гипотезе, данное прозвище ведет свое начало от украинского прилагательного «шаршавий» - «шершавый», то есть «негладкий, неровный, шероховатый», а также «косматый, всклоченный». Возможно, что прозвище Шаршун содержало указание на особенности внешности основателя фамилии (шершавая, возможно, обветренная кожа, или же взъерошенные, растрепанные волосы). Так, например, в Книгу памяти Московской области внесен сторож Шаршун Георгий Никифорович, родившийся в 1912 г. в городе Москва. В Книге памяти Республики Белоруссии упоминается Шаршун Иосиф Стефанович (р. 1881) из деревни Терехи Логойского района Минской области. В Книге памяти Красноярского края области записан Шаршун Леон Степанович (р. 1906), проживавший в городе Двинск.