Фамилия Шайганов — одна из тех, что заставляют задуматься: тюркское ли это наследие, или же за ней скрывается что-то иное. В основе фамилии лежит мужское личное имя Шайган, которое в свою очередь восходит к татарскому или башкирскому прозвищу. В тюркских языках «шай» означает «шах», «господин», «царь», а «ган» — суффикс, указывающий на обладание качеством. Вместе имя Шайган можно перевести как «царственный», «господин». Однако есть и более прозаичная версия: в некоторых диалектах «шайган» — это человек, который много и часто пьет чай («шай» — чай), то есть чаевник, любитель чаепитий. Такое прозвище могли дать завсегдатаю чайханы или просто тому, кто не представлял жизни без чашки чая.

Словообразовательная модель Шайганов — классическая для русских фамилий тюркского происхождения. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «чей?» — Шайганов, то есть сын или потомок Шайгана. Фамилия образована от полной формы имени, без уменьшительных или уничижительных суффиксов, что говорит о том, что прозвище Шайган воспринималось как уважительное или нейтральное, а не как насмешливое.

Географически фамилия Шайганов наиболее распространена среди татар, башкир, а также в смешанных регионах Поволжья и Урала — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Встречается она и у русских, но в таких случаях, скорее всего, предки были крещеными татарами или башкирами, которые сохранили родовое имя в качестве фамилии.

Стоит отметить, что фамилия Шайганов не имеет отношения к фамилии Шайтанов (от «шайтан» — черт). Несмотря на внешнее сходство, корни разные: в первом случае — «шай» (господин, чай), во втором — «шайтан» (злой дух). Путаница возможна, но этимологически эти фамилии расходятся.

Социальный контекст: носители фамилии Шайганов в XIX веке чаще всего были государственными крестьянами или мещанами. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В дореволюционных переписях Шайгановы встречаются в основном в Казанской и Уфимской губерниях, что подтверждает региональную привязку.