Фамилия Шайкиев — редкий случай, когда географический акцент почти наверняка перевешивает все остальные версии. Её основа, «шайки», почти не встречается в русских говорах как самостоятельное слово, зато хорошо знакома в тюркских языках. Скорее всего, фамилия образована от тюркского имени Шайки (Шайкы, Шайкия) с помощью русского патронимического суффикса -ев, который присоединяли к основам на «и». Суффикс указывает на то, что носитель — потомок человека по имени Шайки.

Имя Шайки, в свою очередь, восходит к арабскому «шайх» (старец, старейшина, предводитель). В тюркской среде это имя давали в честь уважаемого человека, духовного наставника или просто как пожелание мудрости и авторитета. Таким образом, прямой перевод фамилии — «сын шейха» или «потомок старейшины». Важно не путать её с более распространённой фамилией Шайкин, которая образована от прозвища Шайка (ватага, группа людей) — у Шайкиева совсем другая смысловая нагрузка.

Географически фамилия тяготеет к регионам с сильным тюркским субстратом: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область, а также к народам Кавказа (особенно кумыки и ногайцы). Встречается и у азербайджанцев, но реже. В русских метрических книгах XIX века фамилия почти не фиксируется, что подтверждает её позднее оформление — скорее всего, в середине — конце XIX века, когда у татар и башкир начали массово закрепляться фамилии по отцу. До этого человека называли просто Шайки — по имени, без фамильного суффикса.

С точки зрения социального статуса предки Шайкиевых, скорее всего, были не крестьянами-землепашцами, а представителями мусульманского духовенства или зажиточными торговцами. Имя Шайки в традиционном обществе давали не случайно: оно несло отпечаток уважения. Однако со временем фамилия «демократизировалась» — её могли получить и потомки простых общинников, если в роду был уважаемый дед с таким именем.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия: от тюркского глагола «шайка» (ломать, крошить) или «шай» (камень, скала). Но она не подкрепляется ни антропонимическими словарями, ни логикой образования фамилий — прозвища от глаголов в тюркской среде обычно давали по действию (например, Богатырев), а не по абстрактному имени. Поэтому основная версия остаётся самой убедительной: Шайкиев — это «потомок того, кого звали Шайки», то есть потомок уважаемого человека, возможно, духовного лидера.