Фамилия Щавкун звучит звонко и необычно. Её происхождение почти наверняка связано с растением щавель. В основе лежит прозвище Щавкун, которое давали человеку с характерной привычкой или внешностью. Чаще всего так называли любителя щавеля — того, кто с особым удовольствием ел щи из щавеля или просто рвал его на лугу. В говорах слово «щавкун» могло означать и болтуна, пустомелю (от глагола «щавкать» в значении «трещать, болтать без умолку»), но эта версия менее вероятна: первая, «растительная», куда нагляднее.

Украинский суффикс -ун указывает на деятеля. В русских фамилиях такой формант встречается реже, чем в украинских, польских или белорусских. Поэтому Щавкун — фамилия, скорее всего, украинского или южнорусского корня. Она образовалась без дополнительного суффикса принадлежности (-ов, -ин), что характерно для прозвищных фамилий, которые закрепились в том виде, в каком их дали. Если бы предка звали просто Щавкун, его дети и внуки так и остались Щавкунами.

Географически фамилия встречается в основном на территории современной Украины и в прилегающих областях России — в Курской, Белгородской, Воронежской. Встречаются и варианты написания: Щавкунов, Щавкуненко — но исходная форма Щавкун самая старая и прямая. В документах XVII–XVIII веков, например в реестрах запорожских казаков или переписных книгах Слобожанщины, могли записать человека по прозвищу Щавкун, и с тех пор фамилия не менялась.

Таким образом, Щавкун — это фамилия-прозвище, которая рассказывает о вкусах или привычках предка: он либо любил щавель, либо был говорлив. В любом случае, корень у неё простой и понятный, без тёмных этимологических загадок.