Фамилия Щекатунова — женская форма, а её мужской вариант — Щекатунов. Это относительно редкая фамилия, и её происхождение напрямую связано с прозвищем или профессией, а не с крестильным именем. Основа фамилии — «щекатун». В русских говорах (особенно южных и западных) «щекатуном» называли того, кто много и попусту болтает, «щекает» — то есть говорит без умолку, тараторит. Слово образовано от глагола «щекатать» (стрекотать, болтать) с помощью продуктивного суффикса деятеля -ун (ср.: говорун, бегун, крикун).

Тип фамилии — патронимический (по отцу), но не от имени, а от прозвища. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «Щекатунов» буквально значит «сын Щекатуна». Такая модель в XVI–XVII веках была основной для крестьян и посадских людей, поэтому сословно фамилия, скорее всего, недворянская. В среде боярства или высшего служилого сословия прозвища с откровенно бытовой или насмешливой окраской закреплялись реже.

Есть и вторая, менее вероятная версия: «щекатун» могло быть диалектным названием ремесленника, который занимался отделкой («щекой») — например, штукатур или облицовщик. В этом случае прозвище перешло бы в фамилию по роду занятий. Но прямое лексическое значение «болтун» в словарях русских говоров встречается чаще и подтверждено устойчивой фразеологией («щекатать языком»), поэтому первая гипотеза выглядит убедительнее.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским областям: её фиксируют в старых переписях Курской, Орловской, Воронежской губерний. Встречается также вариант Щекотунов — с тем же корнем, но с чередованием гласной под влиянием аканья или просто как иная запись одного и того же прозвища. Ударение в фамилии падает на третий слог — Щекату́нов, что типично для отчеств на -унов (ср.: Болтунов, Ворчунов).

Таким образом, предок современных Щекатуновых, скорее всего, был человеком разговорчивым, возможно, балагуром или говорливым мастеровым, за что и получил своё прозвище. Фамилия сохранила живую черту народной речи — прямое и меткое слово, которое без труда понимали в деревне четыреста лет назад.