Основой фамилии Щекотунова послужило мирское имя Щекотун. Фамилия Щекотунова образована от имени Щекотун, которое выполняло, предположительно, охранительную функцию. По русским поверьям, «Щекотун» - это существо, тревожащее детей. Он упоминается в заговорах с целью изгнания назойливо тревожащих ребенка существ, которые персонифицируют бессонницу, например: «Матушка заря утренняя Мария, вечерняя Маремьяна, возьми у младенца полуношника и щекотуна из белого тела, из горячей крови». Вероятно, название этого злого духа связано с названием детской болезни «щекотун», то есть щетинка на теле малыша, которая тревожит младенца, мешает ему спать. В широком смысле щекотунами называют нечисть (леших, русалок), которые «защекачивают» людей до смерти. Вполне вероятно, что имя Щекотун должно было охранять ребенка от нечистой силы и бесонницы. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Щекотун, со временем получил фамилию Щекотунов.