Фамилия Щипахина — женская форма фамилии Щипахин, а та, в свою очередь, образована от прозвища Щипаха. В основе лежит глагол «щипать». В русских говорах слово «щипаха» имело несколько значений, и все они связаны с действием: так могли назвать женщину, которая щиплет лён или пеньку (отходы при трепании), либо человека с беспокойным, «кусачим» характером — того, кто любит задираться, язвить или «щипать» окружающих колкими словами. В некоторых регионах «щипахой» называли и просто сварливую, придирчивую особу.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Щипахин — «сын Щипахи» или «человек из рода Щипахи». Модель типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин образовывались от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а, -я. В отличие от фамилий на -ов, которые чаще давали по отцу, здесь основа — прозвище матери или главы семьи в женской форме, что не редкость для деревенского быта XVII–XVIII веков.

Интересная деталь: в говорах Вологодчины и Архангельской губернии «щипаха» означала ещё и небольшую птицу из отряда куликов — возможно, за манеру быстро перебирать ногами или «щипать» клювом. Если предок получил такое прозвище по птице, то оно могло относиться к человеку подвижному, суетливому или с характерной походкой.

Споров вокруг этимологии почти нет: все версии сходятся к «щипать». Редкая альтернатива — связь с диалектным «щипок» (мелкая монета, скупец), но она менее убедительна, так как форма Щипаха прямо указывает на деятеля, а не на предмет. Фамилия встречается в основном на Русском Севере и в Поволжье, особенно в Кировской и Нижегородской областях, что подтверждает её прозвищное, а не книжное происхождение.

В истории эта фамилия не была дворянской или купеческой — носители Щипахиных в ревизских сказках XIX века числятся чаще всего государственными крестьянами и мещанами. Никаких громких имён в энциклопедиях не зафиксировано, что типично для фамилий, образованных от бытовых прозвищ: они сохранили память о характере или занятии предка, а не о его социальном статусе.