Фамилия Шебонкина — женская форма, в основе которой лежит мужская фамилия Шебонкин. Её разумнее всего рассматривать как русскую фамилию, образованную от прозвища или неканонического имени Шебонка. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — сын или внук Шебонки. Такая модель типична для центральной России и севера, где фамилии на -ин преобладают над -ов.

Основа Шебон- звучит необычно, но вполне объяснима. Скорее всего, это вариант глагола «шебонить» или «шебондить», который в русских говорах имел значение «суетиться, хлопотать, делать что-то мелкое и быстрое», а также «говорить без умолку, тараторить». В вятских и пермских говорах слово «шебоня» означало непоседливого, вертлявого человека. Таким образом, Шебонка — это прозвище егозы, живого и неугомонного человека. Второй, менее вероятный вариант — искажение имени Шебан, которое в старину было уменьшительным от Шебала (древнерусское нецерковное имя, от «шебала» — тряпка, лохмотья, но также и «болтун»). Однако версия с «суетой» кажется более правдоподобной, так как объясняет именно звучание «Шебон-».

Фамилия редкая. Географически она встречается в основном в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает её диалектное происхождение — именно там фиксируются глаголы «шебонить» и «шебондить». Встречаются также варианты написания Шебонкин/Шебонкина, реже Шебанкин. Если ваш предок носил фамилию Шебонкин, он скорее всего был из крестьян или посадских людей, а прозвище дали ему за характер — за живую, непоседливую натуру.