Фамилия Шеченин — редкий случай, когда за основу взято не имя и не профессия, а, скорее всего, местное прозвище, связанное с внешностью или манерой поведения. В её основе лежит слово «щека» (в диалектном произношении — «шека»). Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Шеченин — это «сын Шечени» или «человек из семьи Шечени».

Самого прозвища Шечена в современных источниках не найти, но его смысл восстанавливается по старым русским говорам. «Щекастый», «щекатый» — так называли человека с крупными, круглыми или выдающимися скулами. В некоторых областях «шекой» могли прозвать говорливого, бойкого человека — того, кто «за щеку» не лезет за словом. Есть и другая, менее вероятная версия: от слова «шечить» (диал. «высматривать, сторожить»), но она не подтверждается типовой моделью образования фамилий.

Обратите внимание на чередование «щ/ш». В литературном русском языке форма «Щеченин» была бы логичнее, но фамилия закрепилась именно с «ш». Это типично для северных и северо-восточных говоров, где «щ» произносили как «ш» («шшука», «шшётка»). Поэтому носители фамилии Шеченин с большой вероятностью родом из Вологодской, Архангельской или Кировской областей.

В отличие от массовых фамилий на «-ов», модель на «-ин» характерна для прозвищ, образованных от существительных женского рода или от названий частей тела. Шеченин стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Лобов (лоб), Носов (нос), Ухов (ухо), но с той разницей, что исходное слово у него — не анатомический термин в чистом виде, а живое прозвище.

Сословной принадлежности у фамилии не было: Шеченины встречались и среди крестьян, и среди мещан, и в духовенстве. В XIX веке эта фамилия фиксируется в метрических книгах Вятской и Пермской губерний, что подтверждает её северное происхождение.