Фамилия Шеенков образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Шеенков образована от прозвища Шея. Вероятно, это прозвище получил человек с длинной или толстой шеей. Суффикс –енко в составе фамилии может указывать на ее восточно-украинские корни. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шея, со временем получил фамилию Шеенков. О точном месте и времени возникновения фамилии Шеенков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Шеенков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.