Фамилия Шелковкин образована от прозвища или нецерковного имени Шелковка, а то, в свою очередь, — от прилагательного «шелковый». В русских говорах «шелковкой» могли называть не только торговца шёлком, но и человека с мягким, ласковым характером, «шёлкового» в переносном смысле. Встречается и другая версия: прозвище могло относиться к человеку, который носил одежду из шёлка, что в крестьянской среде было редкостью и сразу бросалось в глаза.

Словообразовательная модель типична для восточнославянских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность — буквально «сын Шелковки». Такая модель преобладала на севере и в центральных областях России, в отличие от южных и западных регионов, где чаще использовали суффикс -енко или -ук.

Любопытно, что фамилия Шелковкин стоит в одном ряду с более распространёнными Шелковым и Шелковниковым. Если Шелков — это просто «сын Шелка» (прозвище человека с шелковистыми волосами или мягким нравом), то Шелковкин — уменьшительная форма, которая могла подчеркнуть молодость или невысокий социальный статус носителя прозвища. Встречается она реже, что делает её интересным объектом для локальных генеалогических поисков.

В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) эта фамилия не выделяется отдельной статьёй, но её основа прозрачна. По данным переписей XIX века, Шелковкины чаще всего фиксировались в северных губерниях — Вологодской, Архангельской, а также в Сибири, куда переселенцы уходили в поисках промыслов. Вероятно, предки носителей фамилии могли быть ремесленниками, связанными с обработкой шёлка, или же просто получили прозвище за свой характер.

Если ваша фамилия Шелковкин, то корни, скорее всего, ведут в среду крестьян или посадских людей, а не дворянства: суффикс -ин в сочетании с прозвищной основой — верный признак незнатного происхождения.