Фамилия Шелковкина — женская форма фамилии Шелковкин, которая образована по редкой для русского ономастикона модели с двойным суффиксом: -овк- + -ин. Если большинство фамилий оканчивается на -ов или -ин, то здесь мы видим более сложную конструкцию: суффикс -овк-, характерный для прозвищ и отфамильных образований (сравните: Козлов → Козловкин, Петров → Петровкин), а затем уже патронимический -ин. Это указывает на то, что фамилия Шелковкин могла возникнуть не напрямую от прозвища Шелковка, а от уже существовавшей фамилии Шелков или Шелковый, к которой добавили уменьшительный суффикс. Такая модель встречается в северных и центральных губерниях России, где фамилии часто дробились и видоизменялись при переходе от отца к сыну.

Основа «шелк-» восходит к общеславянскому названию ткани. Прозвищем Шелк, Шелковый или Шелковка награждали либо ремесленника-шелкоткача, либо торговца шелком, либо человека с мягким, «шелковистым» характером — льстивого или покладистого. В словаре русских фамилий Б. Унбегауна указывается, что прозвища от названий тканей давали по роду занятий, а не по внешности, поэтому версия с ремеслом выглядит предпочтительнее. Шелковое производство на Руси было сосредоточено в Москве и некоторых городах Поволжья, но кустарное ткачество встречалось и в деревнях.

География фамилии Шелковкина неширокая: она встречается в основном в Центральной России и Поволжье. В дореволюционных метрических книгах носители фамилии фиксируются в Тверской, Костромской и Нижегородской губерниях. Интересно, что в некоторых говорах «шелковкой» называли не только ткань, но и особый сорт яблок («шелковка» — сорт с гладкой кожицей), но эта версия менее вероятна для фамилии: прозвища по сортам фруктов давали редко и обычно в южных регионах, где эти яблоки росли.

Сословный состав носителей фамилии, судя по архивным данным, был преимущественно крестьянским и мещанским. Дворянских родов с фамилией Шелковкины не зафиксировано. Это типичная «ремесленная» фамилия, которая указывает на род занятий предка, а не на его происхождение или место жительства. В советское время фамилия не исчезла, но осталась малочисленной — по данным современных телефонных справочников, Шелковкиных в России несколько сотен человек.