Фамилия Шелухина образована от прозвища Шелуха. Так в тамбовских и калужских говорах называли человека, обдирающего на ручных или конных жерновах гречиху на мелкую продажу, а также лабазника, мучника. Кроме того, в ярославских говорах шелухой называли рыбью чешую. Поэтому прозвище Шелуха также мог получить рыбак или повар. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шелуха, со временем получил фамилию Шелухина.