Фамилия Шеншине — редкий случай, когда русская фамилия образована по тюркской модели. Её основа — тюркское прозвище или имя Шеншин, которое восходит к слову шеншин (или шеншен), что в ряде тюркских языков означает «радостный», «весёлый», «благополучный». Суффикс -е в конце — это русский патронимический формант, но здесь он присоединён нестандартно: обычно русские фамилии на -ин образуются от основ на -а/-я (Петя — Петин), а здесь основа твёрдая, и -е выступает как вариант, закрепившийся в документах.

Такая словообразовательная модель встречается у фамилий, которые записывали со слуха в XVI–XVII веках, когда русские писцы передавали тюркские имена и прозвища через русские суффиксы. Шеншине — это не «чей-то сын», а скорее «потомок того, кого звали Шеншин». Если бы фамилия была чисто русской, от прозвища Шенша (гипотетического, от глагола «шеншить» — шуметь, суетиться, что фиксируется в северных говорах), то форма была бы Шеншин, без конечного -е. Наличие -е указывает на то, что фамилия либо оформилась в среде, где смешивались русские и тюркские традиции именования (например, в служилых татарских родах или на южных окраинах), либо была искусственно русифицирована при записи.

Географически фамилия Шеншине привязана к Курской и Орловской губерниям: именно там известен дворянский род Шеншиных, к которому принадлежал поэт Афанасий Фет (настоящая фамилия Шеншин). Но форма Шеншине — более редкая; она могла возникнуть как вариант написания в метрических книгах или при переписи, когда фамилию записывали в родительном падеже («Шеншине» — кого? — и потом закрепили как именительный). Другая версия: это украинизированная форма, где -е соответствует украинскому окончанию фамилий на -енко или -е, но без суффикса -енк-.

В целом, носитель фамилии Шеншине может с высокой вероятностью вести род от тюркского предка с прозвищем «весельчак» или «благополучный», который попал на русскую службу и получил фамилию по местной модели. Сословно предки могли быть служилыми людьми (дворянами или однодворцами), так как фамилия с тюркским корнем и русским суффиксом типична для детей боярских и казачества южных рубежей.