Фамилия Шепченко звучит на украинский лад, и это первая подсказка. Модель образования прозрачна: суффикс -енко указывает на «малого», «сына» или «потомка» человека, чьё имя или прозвище стало основой. В данном случае основа — Шепка или Шепко. А вот откуда взялась сама Шепка, тут возможны варианты.

Самая прямая версия ведёт к глаголу «шептать». Прозвище Шептун или Шептуха давали тому, кто говорил тихо, шепотом, или тому, кто знался с «шепотками» — заговорами, народной магией. В украинском языке слово «шептун» закрепилось именно за знахарем, заговаривающим болезни. В таком случае Шепченко — это «внук знахаря» или «сын того, кто шепчет». Менее распространённая, но возможная версия — связь с диалектным словом «шепка» (щепка, лучина). Прозвище Шепка могли дать худому, щуплому человеку или тому, кто занимался щепным товаром — делал деревянную утварь, лучины.

Интересно, что фамилия Шепченко бытует не только на востоке Украины, но и в южных областях России, куда она попала вместе с переселенцами. В отличие от более известной фамилии Шевченко (от «шевец» — сапожник), Шепченко встречается реже и почти не имеет «громких» исторических носителей, которые бы заслонили собой первоначальный смысл. Поэтому для этой фамилии народная этимология не перебила корневую основу — она осталась в кругу прозвищ, связанных либо с речью, либо с ремеслом, либо с внешностью.