Фамилия Шерченков образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей: основа плюс суффикс -ов (или его вариант -ев). В данном случае — Шерченк-ов. Суффикс -ов обычно присоединялся к именам и прозвищам, оканчивающимся на согласный или -о. Фамилий на -енков в русском языке немало, но Шерченков стоит несколько особняком из-за редкой основы.

Корень «шерч-» неочевиден. Самое вероятное объяснение — прозвище Шерчок или Шерченок, которое дали человеку с необычной речью. В русских говорах «шерчать» означало «говорить с присвистом, шепелявить, картавить» или «издавать шипящие звуки». Так могли прозвать того, кто картавил, или, наоборот, говорил резко, отрывисто. Суффикс -енок в прозвище указывал на молодость или принадлежность: Шерченок — буквально «молодой, который шерчит», или «сын Шерча». Позже это прозвище закрепилось как фамилия в форме Шерченков.

Другая, менее вероятная версия связывает основу с диалектным «шеркать» — «тереть, скрести, царапать». В этом случае прозвище Шерчок мог получить скряга или человек с грубой кожей. Но фонетически «шерч-» ближе к звукоподражательному ряду, чем к действию.

Географически фамилия редкая. Встречается в основном в центральных и южных областях России, а также на Украине — в зоне распространения фамилий на -енко и -енков. Это подтверждает её происхождение из украинской или южнорусской среды, где суффикс -енок был типичен для обозначения детей или малорослых людей.

Таким образом, носитель фамилии Шерченков — потомок человека, которого в XVI–XVII веках прозвали Шерченком за манеру речи. Фамилия сохранила живую черту говора, которая сегодня почти утрачена.