Основой фамилии Шершенков послужило мирское имя Шершень. Фамилия Шершенков восходит к нецерковному имени Шершень, которое происходит от аналогичного названия насекомого. Согласно другой версии, фамилия Шершенков образована от прозвища Шершенок,в основе которого лежит диалектное слово «шершавый» - «лохматый, косматый, всклоченный». В этом случае фамилия указывает на внешиние особенности предка Шершенковых.