Фамилия Шешунников образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Прозвища Шешунник, вероятнее всего, этимологически связано с древнерусским нарицательным «шешень», которое имеет значение «рисовые лепешки». Скорее всего, таким прозвищем прозвали страстного любителя подобного лакомства. Исходя из этого, можно предположить, что прозвище Шешунник носил искусный повар, которому особенно удавались рисовые лепешки. Согласно другой гипотезе, прозвище Шешунник происходит от татарского глагола «шешену», который переводится на русский язык как «пухнуть, распухать, отекать». Вполне возможно, что так прозвали полного человека. Менее вероятно, что прозвище Шешунник восходит к коми-пермяцкому глаголу «шешкыны», который означает «шепелявить». В этом случае, это прозвище указывало на особенности речи предка. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шешунник, со временем получил фамилию Шешунников. О точном месте и времени возникновения фамилии Шешунников в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Шешунников представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.