Фамилия Шешуников — классический пример того, как русская фамилия, на первый взгляд простая, таит в себе сразу несколько возможных историй. Её основа — слово «шешун» или «шешуня», но что оно означало в старину, сегодня уже не очевидно.

Самый прямой и вероятный путь — от прозвища Шешун. В русских говорах (особенно северных и сибирских) «шешуня» — это ласково-пренебрежительное название того, кто шуршит, возится, копошится. Глагол «шешунить» означал «шептаться», «шушукаться», а также «делать что-то тайком, украдкой». Соответственно, Шешуном могли прозвать человека тихого, скрытного, любящего пошептаться или того, кто постоянно шуршит, возится на одном месте. Суффикс -ик в фамилии Шешуников — уменьшительный, он мог указывать на младшего родственника или на то, что прозвище Шешуник закрепилось за человеком небольшого роста или молодым.

Есть и другая, более редкая версия, связанная с ремеслом. В некоторых диалектах «шешун» — это инструмент для очистки зерна или кожевенный скребок. Если так, то фамилия могла достаться от предка-ремесленника, мастера по выделке кож или мельника. Однако эта версия менее распространена: прозвища по орудиям труда обычно образовывались иначе (например, Шило → Шилов), а «Шешун» в этом значении встречается редко.

Фамилия образована по стандартной модели: прозвище Шешуник + патронимический суффикс -ов. Это значит, что в основе лежит имя или прозвище отца: «чей сын?» — «Шешуников». Суффикс -ик в прозвище (Шешуник вместо Шешун) характерен для северных и центральных областей России, где такие формы часто обозначали молодого человека или сына Шешуна.

Географически фамилия Шешуников встречается не повсеместно. Она тяготеет к Вологодской, Архангельской и Кировской областям — регионам, где сохранилась старая диалектная лексика. Встречается она и на Урале, куда переселенцы с Севера принесли свои прозвища.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Шешуков, Шешунов, Шешутин — все они от той же основы, но с разными суффиксами. Шешуников стоит особняком: двойной суффикс (-ик + -ов) делает её более «молодой» по форме и более конкретной — указывает на конкретного человека, а не на целый род.

Таким образом, предок современных Шешуниковых, скорее всего, получил прозвище за свою манеру поведения — тихую, скрытную или суетливую, — и жил на Русском Севере. Фамилия не дворянская и не крестьянская в сословном смысле, а типичная для свободных крестьян и посадских людей, чьи прозвища позже стали наследственными.