Фамилия Шейнога — редкий и яркий пример того, как прозвище, данное по внешности, закрепилось в родовом имени. В её основе лежит устойчивое сочетание «шей нога», которое в старину могло относиться к человеку с необычной походкой, возможно, прихрамывающему или косолапому, когда при ходьбе он как бы «шил» ногой — то есть волочил её, делал характерное движение. В русских говорах глагол «шить» имел и переносное значение «двигать с трудом, тащить». Таким образом, Шейнога — это не про портного, а про походку.

Словообразовательная модель здесь нестандартная: фамилия представляет собой «застывшее» повелительное наклонение с объектом (ср. Вертишейка, Держиморда). В отличие от типичных русских фамилий на -ов или -ин, Шейнога осталась в своей первоначальной прозвищной форме, без дополнительных суффиксов. Это указывает на то, что она могла закрепиться в среде, где фамилии складывались поздно и неофициально — в крестьянской или казачьей среде.

Встречается фамилия преимущественно в западных и южных регионах бывшей Российской империи — на Украине, в Белоруссии, а также среди казачества. По некоторым данным, носители фамилии Шейнога фиксировались в реестрах Запорожского войска, что косвенно подтверждает связь с прозвищем, данным за боевую травму или природную особенность. В польском языке существует аналогичное прозвище Szyjnoga, что говорит о возможном польско-литовском влиянии на формирование фамилии.

Однокоренные фамилии — Шейно, Шейный, а также Шейкин — образованы от той же основы «шея», но в случае с Шейногой основа иная: здесь первая часть не «шея», а глагол «шить». Это распространённая ошибка при этимологическом разборе, но её легко избежать, если вспомнить, что ударение в фамилии падает на второй слог: Шейнога́, а не Ше́йнога.

Точных сведений о сословной принадлежности всех носителей нет, но характер прозвища и география позволяют предположить, что предки современных Шейног были людьми незнатными, скорее всего, крестьянами или казаками. Фамилия не попала в дворянские родословные книги, что типично для прозвищ, описывающих физический недостаток или особенность.