Фамилия Шибышева — женская форма от мужской Шибышев, и в ней сразу заметна редкость основы. Суффикс -ев указывает на типичную модель русских фамилий: от прозвища или имени, оканчивающегося на мягкий согласный или -й. Но что стоит за корнем «Шибыш»? Вероятнее всего, это прозвище, образованное от глагола «шибать» — в старых говорах бить, ударять, швырять, а также сильно пахнуть или отдавать чем-то (отсюда «шибает в нос»). Человек по прозвищу Шибыш мог быть драчливым, резким в движениях, либо обладателем громкого голоса — того, кто «шибает» ударом слова.

Менее правдоподобна, но допустима связь с диалектным словом «шиба» в значении «сторона» или «склон» (например, «на шибу» — на откосе). В таком случае прозвище могло закрепиться за жителем косогора или крутого берега. Однако для фамилии Шибышев такая топографическая версия слабее: суффикс -ыш чаще образует прозвища по действию или свойству, а не по месту.

Географически фамилия тяготеет к восточным и северным русским регионам: встречается в Вятской губернии, Пермском крае, на Урале. Там глагол «шибать» в значении «бить» был особенно употребителен. В метрических книгах XIX века Шибышевы фиксируются как крестьяне и мещане, без связи с каким-либо одним ремеслом — значит, прозвище было личным, а не профессиональным.

Интересная деталь: фамилия сохранила архаичное окончание -ев, хотя основа на -ыш обычно требовала бы суффикса -ов (сравни: Малыш — Малышев, крепыш — Крепышев). Это говорит о том, что прозвище Шибыш в момент закрепления фамилии произносилось с мягким конечным согласным — «Шибышь». Такое чередование нередко встречается в северных говорах, где смягчение шипящих было сильнее. Таким образом, фамилия Шибышева — не просто «потомок драчуна», но и языковой след местного произношения.