Фамилия Шихонцов — наглядный пример того, как суффикс может рассказать о происхождении больше, чем корень. В ней сразу заметна нетипичная модель: суффикс -ов- приставлен к основе, которая сама уже содержит суффикс -ец. Такое двойное оформление встречается реже, чем простые патронимы, и обычно указывает на то, что перед нами не прямое отчество от имени, а отчество от прозвища или фамилии, которая уже бытовала в семье. Проще говоря: сначала было прозвище Шихонец, а от него уже пошла фамилия Шихонцов — «чей-то сын, потомок Шихонца».

Корень ших- почти наверняка восходит к татарскому или башкирскому слову «ших», «шейх» — духовный наставник, старейшина, глава мусульманской общины. В русской среде это слово прижилось как прозвище для человека, который держался степенно, командовал или имел авторитет, либо для выходца из татарских или башкирских земель, где такое звание было распространено. Суффикс -ец в основе Шихонец добавляет значение «человек, связанный с шихом» — возможно, слуга, ученик или просто носитель этого прозвища. Таким образом, первый Шихонец мог быть либо самим уважаемым человеком, получившим прозвище за властный нрав, либо тем, кто состоял при таком лице.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически плотно пересекались русское и тюркское население: Поволжье, Приуралье, южные уезды. Встречается она нечасто, и это дополнительный аргумент в пользу того, что прозвище было локальным, а не общерусским. В некоторых говорах слово «ших» могло означать и просто «шишка», «важная персона» — без прямого религиозного подтекста, что тоже не противоречит бытовому происхождению прозвища.

Иной версии, связывающей фамилию с диалектным «шихан» (холм, курган), придерживаться сложно: суффикс -ец к топонимической основе дал бы скорее Шиханец, а не Шихонец. Фамилия Шихонцов — редкий случай, когда тюркский корень прошел через русскую прозвищную модель и закрепился в почти неузнаваемом виде, сохранив при этом четкую родовую структуру.